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《棉花学报》由中国农学会主办，着重报道有关棉花等经济作物的研究报告、试验简报、综合评述、经验交流、应用技术、科技简讯、信息研究及有关其他生物、绿色食品和环境保护等科技文章。以围绕棉花管理、经营、使用提供信息、传授技术、交流经验、普及知识为主要内容。
1棉花学报专题评述能够反映某个学科或研究领域的最新成果的研究进展、存在的问题以及今后的方向，论文篇幅不限。作者本人或所在室验室在本领域有相当的研究经历和科研成果。
2棉花学报研究论文反映我国植物分子生物学和分子育种领域在基础理论、应用研究和高新技术开发方面的、在国内外公开出版的刊物上尚未发表过的原始研究工作报告。
3棉花学报研究报告为争取时间以简要的形式发表的原始研究工作报告。论文篇幅要求在5-8个印刷页面左右。
4棉花学报专题介绍主要介绍植物分子生物学与分子育种领域的文献综述性论文。论文篇幅要求在6个印刷页面以上。
5学位论文简报主要刊登博士学位论文及优秀硕士论文之大摘要。篇幅要求在2个印刷页面。中英文同时刊登。
6新基因、新种质、新品种主要刊登具有自主知识产权的新基因，经过鉴定或品种审定的新材料及品种。篇幅要求在6个印刷页面左右。
7新思路、新技术、新方法主要刊登我国学者自主发明的新思路、新技术和新方法。篇幅要求在6个印刷页面左右。
